Les scientifiques associent des bactéries intestinales spécifiques à la dépression
Une nouvelle recherche belge révèle un lien entre des types spécifiques de bactéries intestinales et la dépression. Les résultats, publiés dans la revue Microbiologie de la nature, fournissent également des preuves montrant qu'une large gamme de bactéries intestinales peut produire des composés neuroactifs.
Les chercheurs l'ont qualifiée de première étude au niveau de la population sur le lien entre les bactéries intestinales et la santé mentale, regroupant les données de centaines de personnes plutôt que d'étudier des animaux ou des sujets d'essais cliniques.
Pour l'étude, des chercheurs de l'Institut flamand de biotechnologie (VIB-KU Leuven) en Belgique ont comparé les données sur le microbiome fécal avec les diagnostics de dépression des médecins généralistes auprès de 1054 personnes inscrites au projet flamand Gut Flora.
Grâce à cette analyse, ils ont pu identifier des groupes spécifiques de micro-organismes en corrélation positive ou négative avec la santé mentale. Ils ont découvert que deux genres bactériens, Coprococcus et Dialister, étaient systématiquement épuisés chez les personnes souffrant de dépression, quel que soit le traitement antidépresseur.
Les résultats ont été confirmés dans un groupe indépendant de 1 063 personnes de l'étude néerlandaise LifeLinesDEEP, ainsi qu'en examinant un groupe de patients cliniquement déprimés dans les hôpitaux universitaires de Louvain, en Belgique.
«La relation entre le métabolisme microbien intestinal et la santé mentale est un sujet controversé dans la recherche sur le microbiome», a déclaré le professeur Jeroen Raes, directeur de l'étude, de VIB-KU Leuven.
«La notion selon laquelle les métabolites microbiens peuvent interagir avec notre cerveau - et donc notre comportement et nos sentiments - est intrigante, mais la communication microbiome intestinale-cerveau a surtout été explorée dans des modèles animaux, la recherche humaine étant à la traîne. Dans notre étude au niveau de la population, nous avons identifié plusieurs groupes de bactéries qui variaient avec la dépression humaine et la qualité de vie dans les populations.
Lors de recherches antérieures, l’équipe avait identifié une constellation de communautés microbiennes ou un entérotype, caractérisé par un faible nombre microbien et une faible biodiversité, qui était plus répandue chez les patients atteints de la maladie de Crohn. Dans la nouvelle étude, ils ont découvert de manière surprenante un type de communauté similaire lié à la dépression et à une qualité de vie réduite.
«Cette découverte ajoute plus de preuves indiquant la nature potentiellement dysbiotique de l'entérotype Bacteroides2 que nous avons identifié plus tôt. Apparemment, les communautés microbiennes qui peuvent être liées à l'inflammation intestinale et au bien-être réduit partagent un ensemble de caractéristiques communes », a déclaré Raes.
L'équipe de recherche a également développé une technique de calcul permettant d'identifier les bactéries intestinales susceptibles d'interagir avec le système nerveux humain.
Ils ont étudié les génomes de plus de 500 bactéries isolées du tractus gastro-intestinal humain et leur capacité à produire un ensemble de composés neuroactifs, créant essentiellement le premier catalogue de neuroactivité des espèces intestinales. On a découvert que certaines bactéries portaient un large éventail de ces fonctions.
«De nombreux composés neuroactifs sont produits dans l'intestin humain. Nous voulions voir quels microbes intestinaux pourraient participer à la production, à la dégradation ou à la modification de ces molécules », a déclaré la chercheuse et première auteure Mireia Valles-Colomer, doctorante au laboratoire de Raes.
«Notre boîte à outils permet non seulement d'identifier les différentes bactéries qui pourraient jouer un rôle dans les conditions de santé mentale, mais aussi les mécanismes potentiellement impliqués dans cette interaction avec l'hôte», a-t-elle déclaré.
«Par exemple, nous avons constaté que la capacité des micro-organismes à produire du DOPAC, un métabolite du neurotransmetteur humain dopamine, était associée à une meilleure qualité de vie mentale.»
Les résultats sont issus d'analyses bioinformatiques et devront être confirmés expérimentalement. Cependant, les résultats aideront à orienter et à accélérer les futures recherches sur le microbiome humain et le cerveau.
L’espoir est qu’en comprenant l’impact des bactéries de l’estomac sur l’humeur, les futurs traitements pourront cibler ou inclure des changements de régime alimentaire ou l’ajout de suppléments pour aider à améliorer l’humeur, voire la dépression clinique.
Source: VIB