Les gènes manquants sont plus probables chez les personnes autistes
Cela signifie que ces individus - 7% du groupe d'étude - avaient une copie d'un ou plusieurs gènes alors qu'ils auraient dû en avoir deux, ont noté des chercheurs de la Icahn School of Medicine du Mount Sinai à New York.
«C'est la première découverte que de petites délétions affectant un ou deux gènes semblent être courantes dans l'autisme, et que ces délétions contribuent au risque de développement du trouble», a déclaré l'investigateur principal de l'étude, Joseph D. Buxbaum, Ph.D. , professeur de psychiatrie, génétique et génomique et neurosciences.
«Cette conclusion doit être étendue à d'autres échantillons indépendants de TSA afin que nous puissions vraiment comprendre comment le risque se manifeste.»
Ce processus est maintenant en cours, selon Buxbaum. Le Consortium de séquençage de l'autisme, composé de plus de 25 institutions, a reçu une subvention de 7 millions de dollars des National Institutes of Health pour continuer à analyser les génomes de milliers d'individus atteints de TSA au mont Sinaï.
L'autisme, qui affecte environ 1 pour cent de la population, est un trouble du développement que l'on pense être causé par une interaction complexe entre des facteurs génétiques et environnementaux. Bien que le trouble puisse être héréditaire, la majorité des cas d'autisme ne peuvent être attribués à des causes héréditaires connues, selon Buxbaum.
Bien que la recherche ait indiqué qu'il pourrait y avoir jusqu'à 1000 gènes ou régions génomiques qui contribuent à l'autisme, la plupart des études ont recherché des mutations ponctuelles - un changement dans une seule lettre d'ADN sur un gène - ou de grandes zones du génome. , englobant de nombreux gènes, qui est altérée.
Pour leur étude, les chercheurs ont scanné le génome de centaines d'individus à l'aide de la technologie de séquençage génétique. Ils ont recherché une petite variation du nombre de copies - la suppression ou la duplication de gènes - entre des personnes autistes et un groupe témoin de personnes sans trouble.
Pour mener l'étude, ils ont utilisé le séquençage de l'exome pour examiner les 22 000 gènes humains de l'ensemble d'échantillons. Ils ont ensuite analysé ces données à l'aide du programme eXome Hidden Markov Model (XHMM). Ensemble, les outils sont les premiers à pouvoir trouver des suppressions ou des ajouts de la taille d'un seul gène dans le génome, selon les chercheurs.
«Cela nous donne le pouvoir, pour la première fois, d'exécuter un test à partir d'un échantillon de sang et de le comparer à un génome de référence pour rechercher des mutations et une petite variation du nombre de copies chez les patients», a expliqué Buxbaum.
Les chercheurs ont analysé une base de données composée de 431 cas d'autisme et 379 témoins appariés, totalisant 811 personnes. Ils ont trouvé 803 délétions de gènes dans le groupe autiste et 583 délétions dans le groupe témoin. Ils ont également constaté que les personnes autistes avaient une plus grande probabilité d'avoir plusieurs petites délétions.
«Il est maintenant connu que le nombre de copies de gènes imparfaites est l'une des principales sources de variabilité entre les personnes», a déclaré Buxbaum.
«L'une des raisons pour lesquelles nous sommes différents les uns des autres est à cause des ajouts ou des suppressions de gènes, qui sont souvent héréditaires. Mais parmi les suppressions supplémentaires que nous constatons dans les TSA, toutes ne sont pas dues à l'héritage génétique. Certains se produisent pendant le développement de l'ovule ou du sperme, et les délétions qui se développent de cette manière ont tendance à être associées à la maladie.
Les chercheurs ont découvert qu'une proportion importante des délétions de gènes chez les personnes autistes était liée à l'autophagie, un processus qui maintient les cellules en bonne santé en remplaçant les membranes et les organites.
"Il y a une bonne raison de croire que l'autophagie est vraiment importante pour le développement du cerveau parce que le cerveau produit beaucoup plus de synapses qu'il n'en a besoin, et l'excès doit être élagué", a déclaré Buxbaum. «Trop ou trop peu de synapses ont le même effet de ne pas faire fonctionner très bien la communication. Cela pourrait signifier que certaines connexions synaptiques arrivent trop tard et risquent de ne pas se solidifier correctement. "
Les chercheurs disent croire les résultats, publiés dans le Journal américain de génétique humaine, aura une signification clinique.
«Les variations clés du nombre de copies - celles qui apparaissent systématiquement dans une population autiste - peuvent avoir un impact sur les tests génétiques», a conclu Buxbaum.
Source: Hôpital Mount Sinai / École de médecine Mount Sinai
