Le maquillage génétique de la schizophrénie est super compliqué
La nouvelle recherche démontre pourquoi il n’y aura probablement jamais de moyen simple de diagnostiquer la schizophrénie par un test génétique ou sanguin.
La nouvelle recherche, dirigée par Po-Ru Loh de la Harvard School of Public Health, a analysé la composition génétique de 22 177 personnes atteintes de schizophrénie et de 27 629 sujets témoins (Loh et al., 2015). Grâce aux analyses des chercheurs, les chercheurs ont estimé qu'il existe plus de 20 000 polymorphismes à nucléotide unique (SNP) causaux pour la schizophrénie. Les SNP sont le type de variation génétique le plus courant chez les personnes. En termes simples, plus il y a de SNP impliqués dans une maladie, plus la composition génétique de la maladie est complexe.
L'une des innovations de la nouvelle recherche est son algorithme qui peut analyser les séquences et les composants de gènes plus rapidement que les efforts antérieurs: «Nous avons introduit un nouvel algorithme rapide, BOLT-REML, pour l'analyse des composants de variance impliquant plusieurs composants de variance et de multiples traits, et nous avons démontré qu'il permet des analyses d'héritabilité de grands échantillons auparavant insolubles », ont noté les chercheurs.
Dans le cas de la schizophrénie, les chercheurs estiment que chacun de ces plus de 20 000 variantes génétiques représente une petite composante du risque de maladie. Cela rend la maladie hautement polygénique.
Selon le chercheur Po-Ru Loh dans une interview avec Psych Central, ce «nombre extrême de variantes génétiques est bien supérieur aux chiffres prévus pour d'autres maladies courantes». Loh faisait partie de l'équipe qui a publié la nouvelle recherche, qui apparaît dans la revue Génétique de la nature.
Compte tenu du nombre de SNP impliqués dans la schizophrénie, un simple test génétique pour ce trouble est-il possible?
«Un test génétique spécifique pour la schizophrénie serait extrêmement difficile à développer», selon Loh. «Un tel test devrait impliquer l'agrégation des effets sur de nombreuses variantes génétiques (chacune de faible effet), et des échantillons de très grande taille (des millions de participants à l'étude) seraient nécessaires pour estimer avec précision ces petits effets.»
Il s'agit de la première recherche à grande échelle qui a été en mesure d'examiner autant de marqueurs génétiques à un niveau de détail aussi élevé de personnes atteintes de schizophrénie et de les comparer à des personnes sans schizophrénie. En tant que tel, ses découvertes sont une contribution importante à notre compréhension de la génétique de ce trouble.
Mais que nous réserve l'avenir?
«Des échantillons de plus grande taille seront nécessaires pour confirmer et développer ces résultats», a noté Loh. «Avec environ 50 000 échantillons (environ 22 000 cas et 28 000 témoins), nous disposions d'une puissance statistique suffisante pour étudier les distributions à l'échelle du génome des effets génétiques à une résolution plus élevée qu'auparavant, mais des études futures d'une taille encore plus grande fourniront sans aucun doute une résolution plus fine et plus insights. »
Des recherches innovantes comme celle-ci démontrent à quel point nous n'avons pas encore appris sur les causes sous-jacentes de la maladie mentale.
Référence
Loh, P-R. et coll. (2015). Architectures génétiques contrastées de la schizophrénie et d'autres maladies complexes en utilisant une analyse rapide des composantes de la variance. Nature Genetics. doi: 10.1038 / ng.3431
