Twitter aide à identifier les interactions médicamenteuses dangereuses

Un nouveau logiciel qui exploite les données Twitter peut identifier les interactions médicamenteuses potentiellement dangereuses et les effets secondaires avant qu'ils n'apparaissent dans les bases de données traditionnelles.

Des informaticiens interdisciplinaires de l'Université du Vermont ont créé un programme informatique qui peut rechercher efficacement des millions de tweets sur Twitter pour les noms de nombreux médicaments et médicaments - et créer une carte de la façon dont ils sont connectés - en utilisant les #hashtags qui les relient.

Les chercheurs affirment que le logiciel peut découvrir des interactions médicamenteuses potentiellement dangereuses et des effets secondaires inconnus avant qu'ils n'apparaissent dans des bases de données médicales, comme PubMed, ou même avant que les médecins et les chercheurs n'en aient entendu parler.

«Notre nouvel algorithme est un excellent moyen de faire des découvertes qui peuvent être suivies et testées par des experts tels que des chercheurs cliniques et des pharmaciens», a déclaré Ahmed Abdeen Hamed, informaticien à l'Université du Vermont qui a dirigé la création du nouvel outil.

Un rapport sur le fonctionnement de l'algorithme et ses découvertes préliminaires apparaît en ligne dans le Journal de l'informatique biomédicale.

«Nous ne savons peut-être pas quelle est l'interaction, mais avec cette approche, nous pouvons rapidement trouver des preuves claires de médicaments qui sont liés entre eux via des hashtags», a déclaré Hamed.

Les chercheurs pensent que la nouvelle approche pourrait également être utilisée pour générer des alertes publiques, a déclaré Hamed, avant le début d'une enquête clinique ou avant que les prestataires de soins de santé n'aient reçu des mises à jour. «Cela peut nous dire: nous assistons peut-être à une interaction médicamenteuse ici», a déclaré Hamed. "Il faut se méfier."

Les chercheurs pensent également que la méthode peut aider à surmonter un problème de longue date dans la recherche médicale: les études publiées ne sont trop souvent pas liées à de nouvelles découvertes scientifiques, car les bibliothèques numériques «souffrent de marquages ​​peu fréquents». Autrement dit, la mise à jour des informations numériques importantes telles que les mots clés et les métadonnées associés aux études est une tâche manuelle laborieuse, souvent retardée ou incomplète.

«L'exploitation des hashtags Twitter peut nous donner un lien entre les preuves scientifiques émergentes et PubMed», a déclaré Hamed la base de données massive gérée par la US National Library of Medicine. À l'aide de leur nouvel algorithme, l'équipe du Vermont a créé un site Web qui permettra à un enquêteur d'explorer les liens entre les termes de recherche (par exemple «albuterol»), les études scientifiques existantes indexées dans PubMed - et les hashtags Twitter associés aux termes et aux études.

Des études antérieures ont montré que Twitter peut être exploité pour de mauvaises interactions médicamenteuses, mais l'équipe du Vermont avance cette idée en se concentrant sur les informations distinctives contenues dans les hashtags - comme «#overprescribed», «#kidneystoneprobs» et «#skinswelling» - pour trouver nouvelles associations.

«Chaque hashtag individuel fonctionne presque comme un neurone dans le cerveau humain, envoyant un signal spécifique», écrivent les scientifiques, qui peut révéler une voie surprenante entre deux médicaments ou plus.

L’approche de l’équipe consiste à créer ce qu’elle appelle un «réseau K-H» - essentiellement une carte dense de liens entre les mots-clés et les hashtags - puis à éliminer une grande partie du «bruit et des déchets», dit Hamed, «c'est Twitter!» - pour trouver les termes qui sont au cœur du réseau. Ensuite, l'algorithme, appelé HashPairMiner, recherche dans ce réseau nettoyé les chemins les plus courts entre une paire de termes de recherche et leurs hashtags intermédiaires.

L'objectif général du projet, soutenu par la National Science Foundation, est de «découvrir toute relation entre deux médicaments qui n'est pas connue», a déclaré Hamed. Mais pour «vérifier sur le terrain l'hypothèse» - que l'exploration de données sur Twitter peut trouver des interactions médicamenteuses inconnues - l'équipe a voulu démontrer que leur approche «peut produire des interactions déjà connues», déclare Tamer Fandy, professeur de sciences pharmaceutiques à le campus de l'Albany College of Pharmacy au Vermont et co-auteur de la nouvelle étude.

«C'est vrai», a déclaré Hamed. Dans un exemple de la nouvelle étude, un chemin entre l'aspirine et le médicament contre les allergies benadryl, qui sont connus pour interagir, a été détecté par l'algorithme; dans un cas, les deux médicaments étaient liés - peut-être pas trop surprenant - par le hashtag «#happythanksgiving».

Le nouveau système a commencé avec ce que Hamed de l'Université du Vermont pensait initialement être une erreur en novembre 2013. Une version antérieure de l'algorithme actuel «a découvert quelque chose de choquant: l'ibuprofène et la marijuana médicale - qui, selon vous, n'ont rien à voir les uns avec les autres - étaient lié par un hashtag appelé # Alzheimer », dit Hamed.

«Je pensais que c'était une erreur. J'ai regardé mon code. J'ai répété mon expérience. J'ai rassemblé différents ensembles de données de tweets - et j'ai obtenu le même résultat », a-t-il déclaré. Mais il n’a pas trouvé de support pour l’association sur PubMed ou d’autres bases de données de littérature clinique. En fait, la seule étude qu'il a pu trouver, à partir de 1989, suggérait le contraire, qu'il n'y avait pas d'interaction entre l'ibuprofène et la marijuana.

Il s'est avéré que Hamed avait découvert par inadvertance des personnes dans Twitterverse qui partageaient les résultats d'une toute nouvelle étude évaluée par des pairs suggérant que l'ibuprofène a une certaine capacité à bloquer ou à réduire les effets néfastes sur la mémoire de la consommation régulière de marijuana, ce qui a été associé. avec le développement de la maladie d'Alzheimer. "Il est apparu sur Twitter avant PubMed", a déclaré Hamed.

Alors que de plus en plus d'États légalisent la marijuana, a déclaré Hamed, il pourrait y avoir de plus en plus de discussions sur ses interactions avec d'autres médicaments - en avance sur la capacité des chercheurs à étudier ces interactions.

«Si nous sommes capables de détecter des inquiétudes - disons des discussions sur des maux de tête ou des baisses de tension artérielle ou autre,» dit-il, «cela peut conduire les pharmaciens ou les chercheurs à une hypothèse qui peut être suivie par un essai clinique ou un autre test médical. "

Source: Université du Vermont