Une étude révèle que les sites génomiques sont liés à la dépression

Une nouvelle étude génomique a identifié pour la première fois 15 régions du génome qui semblent être associées à la dépression chez des individus d'ascendance européenne.

Dans l'étude, les chercheurs ont utilisé une nouvelle méthode d'inscription des participants. Plutôt que de recruter des participants puis de séquencer des gènes, les chercheurs ont analysé des données déjà partagées par des personnes qui avaient acheté leurs propres profils génétiques via un service en ligne et avaient choisi de participer à son option de recherche.

Cela a permis de tirer parti de la puissance statistique d'une taille d'échantillon énorme pour détecter des signaux génétiques faibles associés à un diagnostic probablement traçable à plusieurs processus de maladie sous-jacents. Cette utilisation créative des données collectées a été confirmée par les résultats des approches génétiques traditionnelles de l'étude.

Les résultats de l'étude apparaissent dans une publication préalable en ligne dansGénétique de la nature.

«L'identification des gènes qui affectent le risque de maladie est une première étape vers la compréhension de la biologie de la maladie elle-même, ce qui nous donne des objectifs à viser dans le développement de nouveaux traitements», déclare Roy Perlis, MD, M.Sc., au Massachusetts General Hospital, co -auteur correspondant du rapport.

«Plus généralement, trouver des gènes associés à la dépression devrait aider à préciser qu'il s'agit d'une maladie du cerveau, qui, nous l'espérons, diminuera la stigmatisation encore associée à ces types de maladies.»

S'il est bien connu que la dépression peut fonctionner dans les familles, la plupart des études génétiques précédentes n'ont pas été en mesure d'identifier des variantes influençant le risque de dépression.

Une étude a trouvé deux régions génomiques susceptibles de contribuer au risque de maladie chez les femmes chinoises, mais ces variantes sont extrêmement rares dans d'autres groupes ethniques.

Perlis et ses collègues notent que les nombreuses formes différentes dans lesquelles la dépression apparaît et affecte les patients impliquent que, comme pour d'autres troubles psychiatriques, elle est probablement influencée par de nombreux gènes avec des effets qui pourraient être trop subtils pour être trouvés dans des études antérieures relativement petites.

Contrairement aux méthodes traditionnelles de recrutement des participants à l'étude - qui impliquent de rechercher et d'inscrire des participants potentiels, puis de mener des entretiens complets avant de génotyper réellement chaque individu - cette étude a utilisé des données collectées auprès de clients de 23andMe, une société de tests génétiques s'adressant directement aux consommateurs, qui ont consenti à participer. dans la recherche.

La participation comprend le fait de répondre à des sondages et de remplir des informations sur les antécédents médicaux, ainsi que des informations physiques et démographiques. La plate-forme de recherche de 23andMe utilise des données agrégées non identifiantes.

Pour la présente étude, les chercheurs ont d'abord analysé la variation génétique commune en utilisant les données de plus de 300000 personnes d'ascendance européenne de la base de données 23andMe, dont plus de 75000 ont déclaré avoir été diagnostiquées ou traitées pour la dépression et plus de 230000 sans antécédents déclarés de dépression. dépression.

Cette analyse a identifié deux régions génomiques - l'une contenant un gène mal compris connu pour être exprimé dans le cerveau et l'autre contenant un gène précédemment associé à l'épilepsie et à la déficience intellectuelle - comme étant significativement associées au risque de dépression.

L'équipe de recherche a combiné ces informations avec les données d'un groupe d'études d'association à l'échelle du génome plus petites recrutant environ 9200 personnes ayant des antécédents de dépression et 9500 témoins, puis a analysé de plus près les sites de gènes à risque possibles dans des échantillons d'un autre groupe de clients 23andMe - presque 45 800 avec dépression et 106 000 témoins.

Les résultats ont identifié 15 régions génomiques, dont 17 sites spécifiques, comme étant associées de manière significative à un diagnostic de dépression. Plusieurs de ces sites sont situés dans ou à proximité de gènes connus pour être impliqués dans le développement du cerveau.

«Les modèles basés sur les neurotransmetteurs que nous utilisons actuellement pour traiter la dépression ont plus de 40 ans et nous avons vraiment besoin de nouvelles cibles de traitement. Nous espérons que la découverte de ces gènes nous orientera vers de nouvelles stratégies de traitement », a déclaré Perlis, professeur agrégé de psychiatrie à la Harvard Medical School.

«Un autre point clé de notre étude est que la manière traditionnelle de faire des études génétiques n'est pas la seule qui fonctionne. L'utilisation de grands ensembles de données ou de biobanques existants peut être beaucoup plus efficace et peut être utile pour d'autres troubles psychiatriques, tels que les troubles anxieux, pour lesquels les approches traditionnelles n'ont pas non plus été couronnées de succès.

Source: Hôpital général du Massachusetts