Gènes communs liés à l'autisme
De nouvelles recherches mettent en lumière l'autisme alors que les scientifiques découvrent que la majeure partie du risque génétique de la maladie provient de versions de gènes qui sont courantes dans la population plutôt que de variantes rares ou de mutations spontanées.
Dans la plus grande étude du genre à ce jour, l'héritabilité l'emportait sur les autres facteurs de risque.
Plus précisément, environ 52% du risque d'autisme a été attribué à une variation héréditaire commune et rare, les mutations spontanées représentant un modeste 2,6% du risque total.
«La variation génétique représente probablement environ 60% de la responsabilité de l'autisme, les variantes communes constituant l'essentiel de son architecture génétique», a expliqué Joseph Buxbaum, Ph.D.
«Bien que chacun n’exerce qu’un petit effet individuellement, ces variations communes du code génétique s’additionnent à un impact substantiel, prises ensemble.»
Buxbaum et ses collègues ont rapporté leurs conclusions dans la revue Génétique de la nature.
«Grâce à l'augmentation de la puissance statistique associée à une grande taille d'échantillon, les généticiens de l'autisme peuvent désormais détecter les variations génétiques communes et rares associées au risque», a déclaré Thomas R. Insel, MD, directeur de l'Institut national de la santé mentale (NIMH) .
«Connaître la nature du risque génétique révélera des indices sur les racines moléculaires de la maladie. La variation commune peut être plus importante que nous le pensions. »
Bien que l'on pense que l'autisme est causé par une interaction de facteurs génétiques et autres, y compris environnementaux, le consensus sur leurs contributions relatives et les contours de son architecture génétique est resté insaisissable.
Récemment, des preuves se sont multipliées selon lesquelles les génomes des personnes atteintes d'autisme sont susceptibles d'héberger des mutations rares, souvent spontanées, qui exercent des effets puissants et peuvent en grande partie expliquer des cas particuliers de maladie.
Il est plus difficile de mesurer l'impact collectif sur le risque d'autisme de nombreuses variations du code génétique partagé par la plupart des gens, qui sont individuellement beaucoup plus subtils.
Les limites de la taille et de la composition de l'échantillon ont rendu difficile la détection de ces effets et l'estimation de l'influence relative de ces variations spontanées courantes, rares héritées et rares.
Les différences de méthodes et de modèles statistiques ont également abouti à des estimations parfois très divergentes de l'héritabilité de l'autisme - allant de 17 à 50 pour cent.
Pendant ce temps, des études récentes sur la schizophrénie à l'échelle du génome ont permis d'obtenir des échantillons suffisamment grands pour révéler l'implication de bien plus de 100 variantes génétiques courantes dans ce trouble.
Ceux-ci promettent une meilleure compréhension de la biologie sous-jacente - et même le développement de scores de risque, qui pourraient aider à prédire qui pourrait bénéficier d'interventions précoces pour étouffer les épisodes psychotiques dans l'œuf.
Les chercheurs pensent que la nouvelle étude améliore considérablement la génétique de l'autisme.
L’étude a été rendue possible grâce au registre de santé universel de la Suède, qui a permis aux enquêteurs de comparer un très large échantillon d’environ 3 000 personnes autistes avec des témoins appariés.
Les chercheurs ont également mis en œuvre de nouvelles méthodes statistiques qui leur ont permis de trier de manière plus fiable l'héritabilité de la maladie.
En outre, ils ont pu comparer leurs résultats avec une étude parallèle menée auprès de 1,6 million de familles suédoises, qui a pris en compte les données des jumeaux et des cousins, et des facteurs tels que l’âge du père à la naissance et les antécédents psychiatriques des parents.
«Il s’agit d’un type d’analyse différent de celui utilisé dans les études précédentes», a expliqué Thomas Lehner, Ph.D., chef de la division de recherche en génomique du NIMH.
«Les données d'études d'association à l'échelle du génome ont été utilisées pour identifier un modèle génétique au lieu de se concentrer uniquement sur l'identification des facteurs de risque génétiques. Les chercheurs ont pu choisir parmi tous les cas de maladie dans un registre basé sur la population. »
Maintenant que l'architecture génétique est mieux comprise, les chercheurs identifient des facteurs de risque génétiques spécifiques détectés dans l'échantillon, tels que des délétions et duplications de matériel génétique et des mutations spontanées.
«Même si ces rares mutations spontanées ne représentaient qu'une petite fraction du risque d'autisme, les effets potentiellement importants de ces problèmes en font des indices importants pour comprendre les fondements moléculaires du trouble», ont déclaré les chercheurs.
«Au sein d'une famille donnée, les mutations pourraient être un déterminant critique qui conduit à la manifestation d'un trouble du spectre autistique chez un membre particulier de la famille», a déclaré Buxbaum.
«La famille peut avoir une variation commune qui la met en danger, mais s'il y a aussi une mutation de novo [spontanée} en plus de cela, cela pourrait pousser un individu au-dessus du bord. Ainsi, pour de nombreuses familles, l'interaction entre les facteurs génétiques communs et spontanés pourrait être l'architecture génétique sous-jacente de la maladie.
Source: Institut national de la santé mentale