Le jeu informatique Phylo fait progresser la recherche en santé
Le jeu, appelé Phylo, a été développé par l'informaticien Dr Jérôme Waldispuhl de l'Université McGill et son collaborateur Mathieu Blanchette en 2010.
Phylo est conçu pour permettre aux joueurs occasionnels de contribuer à la recherche scientifique en organisant plusieurs séquences de blocs colorés qui représentent l'ADN humain. En examinant les similitudes et les différences entre ces séquences d'ADN, les scientifiques peuvent acquérir de nouvelles connaissances sur une variété de maladies génétiquement modifiées.
Au cours de l’année écoulée, les 17 000 utilisateurs enregistrés de Phylo ont pu simplement jouer au jeu pour le plaisir ou choisir d’aider à décoder une maladie génétique particulière.
"Beaucoup de gens ont dit qu'ils aimaient jouer à un jeu qui pourrait aider à retracer l'origine d'une maladie spécifique comme l'épilepsie", a déclaré Waldispuhl.
"Il y a beaucoup d'enthousiasme à l'idée de jouer à un jeu et de contribuer à la science en même temps", a reconnu Blanchette. «C'est un jeu sans culpabilité; maintenant vous pouvez vous dire que ce n’est pas seulement du temps perdu. »
Waldispuhl et ses étudiants ont eu l'idée d'utiliser un jeu vidéo pour résoudre le problème de l'alignement de séquences multiples de l'ADN, car c'est une tâche difficile à faire pour les ordinateurs.
«Le cerveau humain effectue certains calculs plus efficacement que n'importe quel ordinateur. La reconnaissance et le tri des modèles visuels entrent dans cette catégorie », a expliqué Waldispuhl.
«Les ordinateurs sont les meilleurs pour gérer de grandes quantités de données désordonnées, mais là où nous avons besoin d'une grande précision, nous avons besoin d'humains. Dans ce cas, les génomes que nous analysons ont déjà été pré-alignés par des ordinateurs, mais il y en a des parties qui sont mal alignées. Notre objectif est d'identifier ces pièces et de transformer la tâche de les aligner en un puzzle que les gens voudront résoudre. »
Depuis le lancement du jeu en novembre 2010, les chercheurs ont reçu plus de 350 000 solutions aux problèmes de séquence d'alignement.
«Phylo a contribué à améliorer notre compréhension de la régulation de 521 gènes impliqués dans diverses maladies. Cela confirme également que des problèmes de calcul difficiles peuvent être intégrés dans un jeu occasionnel qui peut facilement être joué par des personnes sans aucune formation scientifique », a déclaré Waldispuhl.
«Ce que nous faisons ici est différent des approches classiques de la science citoyenne. Nous ne substituons pas les humains aux ordinateurs ni ne leur demandons de concurrencer les machines. Ils travaillent ensemble. C’est une synergie d’humains et de machines qui aide à résoudre l’un des problèmes biologiques les plus fondamentaux. »
Source: Université McGill
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